Prioritization of candidate cancer genes-an aid to oncogenomic studies

The development of techniques for oncogenomic analyses such as array comparative genomic hybridization, messenger RNA expression arrays and mutational screens have come to the fore in modern cancer research. Studies utilizing these techniques are able to highlight panels of genes that are altered in cancer. However, these candidate cancer genes must then be scrutinized to reveal whether they contribute to oncogenesis or are coincidental and non-causative. We present a computational method for the prioritization of candidate (i) proto-oncogenes and (ii) tumour suppressor genes from oncogenomic experiments. We constructed computational classifiers using different combinations of sequence and functional data including sequence conservation, protein domains and interactions, and regulatory data. We found that these classifiers are able to distinguish between known cancer genes and other human genes. Furthermore, the classifiers also discriminate candidate cancer genes from a recent mutational screen from other human genes. We provide a web-based facility through which cancer biologists may access our results and we propose computational cancer gene classification as a useful method of prioritizing candidate cancer genes identified in oncogenomic studies.

Análisis econométrico de los casos de cáncer en mujeres

[ES] El presente Trabajo de Fin de Grado trata, en primera instancia, de proporcionar una visión detallada sobre los diferentes tipos de cáncer en mujeres, detallando los más padecidos entre ellas y facilitando una serie de datos relacionados con la incidencia, la mortalidad y la prevalencia a cinco años. Además de analizar los diversos factores que favorecen la aparición del cáncer en las personas. En la segunda parte del trabajo, se analiza a través de la especificación y estimación de modelos paramétricos, el efecto de diferentes variables sobre la supervivencia a esta enfermedad en las mujeres. Entre las variables que se han tenido en cuenta están la edad en el momento en que se diagnostica el cáncer, el tamaño del mismo y el grado, además de variables como la raza, si la mujer es de origen hispano y el estado civil. Los datos utilizados en el presente trabajo han sido obtenidos de la base de datos: SEER CANCER RESEARCH DATABASE, del Instituto Nacional de Cáncer de Estados Unidos (2013).